Rekrutacja do Szkoły Doktorskiej NoKF odbywa się zgodnie z art. 200 Ustawy PoSWN oraz rozdziałem 3, §7 Regulaminu Szkoły Doktorskiej. Proces ten prowadzony jest w drodze konkursu, na zasadach określonych i zatwierdzonych przez Senat AKF w Krakowie, zaproponowanych przez Dyrektora Szkoły Doktorskiej w porozumieniu z Kolegium Szkoły Doktorskiej. Opis organizacji procesu rekrutacji wraz z terminarzem określony jest corocznie w "Zasadach rekrutacji do Szkoły Doktorskiej Nauk o Kulturze Fizycznej". Proces rekrutacyjny rozpoczyna się w sierpniu rejestracją w Internetowym Systemie Rekrutacji (IRK).